BigWig é um formato de arquivo para exibição de dados densos e contínuos em uma trilha do navegador de genoma, criado pela conversão do formato Wiggle (WIG). O formato BigWig é descrito no site da UCSC Genome Bioinformatics, e o guia de formato de arquivo do Broad Institute fornece informações adicionais.
O que é o formato bigWig?
O formato bigWig é para exibição de dados densos e contínuos que serão exibidos como um gráfico Arquivos BigWig são criados inicialmente a partir de arquivos do tipo WIG, usando o programa UCSC wigToBigWig. Alternativamente, arquivos bigWig podem ser criados a partir de arquivos bedGraph, usando o programa UCSC bedGraphToBigWig.
Como uso o arquivo bigWig?
Mova o arquivo bigWig recém-criado (myBigWig.bw) para um local http, https ou ftp acessível pela web. Cole o URL no formulário de entrada de faixa personalizada ou construa uma faixa personalizada usando uma única linha de faixa. Cole a linha de faixa personalizada na caixa de texto na página de gerenciamento de faixa personalizada.
O que é uma faixa bigWig?
bigWig Tracks são tracks para sinais contínuos em todo o genoma. Eles são adequados para exibir vários resultados de experimentos “brutos”, como sinais ChIP-Seq, sinais RNA-Seq, etc.
Como crio um arquivo bigWig?
Existem várias maneiras de gerar arquivos de figurões. Isso geralmente envolve a conversão de um arquivo. bam para uma trilha wiggle (. wig) e, em seguida, convertendo a trilha wiggle em um bigwig binário (.
