BLAST é um algoritmo de computador que está disponível para uso online no site do National Center for Biotechnology Information (NCBI), bem como em muitos outros sites. O BLAST pode alinhar e comparar rapidamente uma sequência de DNA de consulta com um banco de dados de sequências, o que o torna uma ferramenta crítica na pesquisa genômica em andamento.
O BLAST é um banco de dados primário?
BLAST é o software mais utilizado na pesquisa de bioinformática. Sua principal função é comparar uma sequência de interesse, a sequência de consulta, com sequências em um grande banco de dados O BLAST então relata as melhores correspondências, ou “hits”, encontradas no banco de dados. Este programa simples tem duas aplicações principais.
O NCBI é um banco de dados?
O NCBI abriga uma série de bancos de dados relevantes para biotecnologia e biomedicina e é um importante recurso para ferramentas e serviços de bioinformática. Os principais bancos de dados incluem GenBank para sequências de DNA e PubMed, um banco de dados bibliográfico para literatura biomédica. Outros bancos de dados incluem o banco de dados NCBI Epigenomics.
O BLAST é empregado apenas em bancos de dados NCBI?
BLAST está disponível na web no site do NCBI. Diferentes tipos de BLASTs estão disponíveis de acordo com as sequências de consulta e os bancos de dados de destino.
Como funciona o banco de dados BLAST?
Como o BLAST funciona? BLAST identifica sequências homólogas usando um método heurístico que inicialmente encontra correspondências curtas entre duas sequências; assim, o método não leva em consideração todo o espaço de sequência. Após a correspondência inicial, o BLAST tenta iniciar alinhamentos locais a partir dessas correspondências iniciais.
